Фінансову звітність за попередні роки (з моменту офіційної реєстрації Національного агентства, як юридичної особи) можна переглянути за відповідними посиланнями:
Національне агентство із забезпечення якості вищої освіти як бюджетна установа здійснює свою діяльність за рахунок загального фонду державного бюджету, а також за рахунок спеціального фонду. Спеціальний фонд наповнюється (в основному) за рахунок плати за акредитацію освітніх програм.