Національне агентство має тривалу історію співпраці з Українським інститутом науково-технічної експертизи та інформації (УкрІНТЕІ), що ґрунтується на Меморандумі про співпрацю, підписаному у 2022 році.
12 червня 2025 року в офісі Національного агентства відбулася робоча зустріч Голови Андрія Бутенка, заступниці керівника секретаріату Олександри Осіюк, представників відділу з питань академічної доброчесності та діяльності разових рад на чолі з Леонтієм Шипіловим із керівництвом УкрІНТЕІ.
Учасники обговорили питання наповнення локальних репозитаріїв кваліфікаційними роботами магістрів і бакалаврів, синхронізації інформаційної системи NAQA.svr з центральним репозитарієм, що є складовою Національного репозитарію академічних текстів (НРАТ), розпорядником якого виступає УкрІНТЕІ.
За результатами зустрічі досягнуто домовленостей щодо поглиблення співпраці та реалізації спільних ініціатив.