Національне агентство із забезпечення якості вищої освіти було створено Законом України «Про вищу освіту» влітку 2014 року, але розпочало свою офіційну діяльність у 2019 році. У грудні 2018 року Міжнародною конкурсною комісією був обраний новий склад Національного агентства, який був затверджений Кабінетом Міністрів України. Голова та заступники голови були обрані та затверджені у лютому 2019 року.
Національне агентство – молода, але дуже амбітна та працьовита команда. З літа 2019 року Національне агентство успішно започаткувало новий підхід до процедури акредитації наоснові Європейських стандартів ESG-2015. Національне агентство набрало та підготувало приблизно 3000 експертів для з акредитації та 380 членів галузевих експертних рад.